Shine Stacker

Shine Stacker es una aplicación de focus stacking para microscopía, fotografía macro y imágenes computacional. El software admite entrada en JPEG, TIFF de 8 y 16 bits, PNG y la mayoría de formatos RAW. La salida puede ser JPEG, TIFF de 8 y 16 bits y PNG. Procesa cientos de imágenes por lote: alinea, balancea y combina capas. Su arquitectura modular permite combinar módulos de procesamiento según las necesidades del proyecto. Incluye retoque interactivo final de la imagen apilada a partir de fotogramas individuales. Para programadores, ofrece API de Python y soporte para Jupyter Notebook.

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• Alineación de imágenes. Corrige el desplazamiento entre fotogramas causado por vibraciones o movimiento de la muestra. El algoritmo detecta puntos característicos y transforma cada capa para que coincida espacialmente con las demás, garantizando que los detalles finos se superpongan correctamente.
• Balance de exposición y color. Normaliza el brillo y el balance de blancos entre las diferentes tomas. Compensa variaciones en la iluminación del microscopio o cambios en la apertura del diafragma, evitando diferencias de tono en la pila final.
• Detección de regiones enfocadas. Analiza la nitidez local en cada píxel mediante transformadas wavelet o gradientes. Genera mapas de enfoque que determinan qué áreas de cada fotograma contribuirán al resultado fusionado.
• Fusión por profundidad de campo. Combina selectivamente las zonas nítidas de todas las imágenes. El motor de apilamiento mezcla los píxeles según su nivel de enfoque, produciendo una sola toma con toda la escena nítida de principio a fin.
• Retoque interactivo de capas. Interfaz gráfica que muestra la pila completa y permite pintar manualmente áreas de cada fotograma para incluirlas o excluirlas. El usuario puede corregir artefactos o seleccionar regiones específicas con brochas de opacidad variable.
• Procesamiento por lotes (batch). Ejecuta flujos de trabajo completos sobre carpetas de proyectos. Lee configuraciones predefinidas y apila cientos de series de imágenes sin intervención manual, ideal para volúmenes grandes de datos.
• API Python y scripts. Expone todas las funciones de apilamiento como módulos importables. Los desarrolladores pueden construir pipelines personalizados, automatizar tareas repetitivas e integrar Shine Stacker en sistemas de adquisición existentes.
• Soporte para Jupyter Notebook. Proporciona ejemplos y funciones específicas para trabajar dentro de notebooks. Permite visualizar paso a paso el alineamiento, los mapas de enfoque y la fusión, facilitando la experimentación y la docencia.
• Arquitectura modular de módulos. Desacopla los componentes de alineación, balance y stacking. Los usuarios pueden intercambiar implementaciones de cada etapa (por ejemplo, usar SIFT u ORB para alinear) según las características de sus imágenes.
• Manejo de formatos RAW. Decodifica archivos crudos de cámaras y microscopios mediante librerías integradas. Conserva la profundidad de bits original y los metadatos EXIF, permitiendo trabajar con la máxima calidad desde el origen.
• Generación de máscaras de profundidad. Crea mapas de profundidad relativos a partir de la secuencia de enfoque. Estos mapas pueden exportarse como imágenes de 16 bits para su uso en modelado 3D o análisis topográfico.
• Perfiles de proyecto guardables. Almacena todas las opciones de procesamiento en archivos de configuración. Los perfiles permiten repetir exactamente el mismo flujo de trabajo en diferentes series de imágenes, garantizando reproducibilidad en entornos de investigación.

El desarrollo de Shine Stacker comenzó en 2023. La aplicación está escrita en Python, utilizando bibliotecas científicas como NumPy, SciPy y OpenCV para el procesamiento de imágenes. El proyecto es mantenido por lucalista y otros colaboradores en GitHub.

Alternativas a Shine Stacker:

ImageJ

ImageJ es un programa de procesamiento de imágenes de dominio público basado en Java desarrollado por los National Institutes of Health.

Precio: Gratis   Tamaño: 47.7 MB   Versión: 154   SO: Windows, Linux, MacOS

AlterPhoto

AlterPhoto es una aplicación de edición fotográfica y manipulación de imágenes para Windows.

Precio: Gratis   Tamaño: 58.7 MB   Versión: 3.0   SO: Windows

Helicon Focus

Helicon Focus es un programa diseñado para combinar múltiples imágenes con diferentes planos de enfoque en una sola fotografía completamente nítida.

Precio: Gratis   Tamaño: 119 MB   Versión: 8.3.5   SO: Windows, Mac OS